- Peringkat Nasional: 117
- Peringkat dunia: 5941
9. Universitas AMIKOM Yogyakarta
- Peringkat Nasional: 122
- Peringkat dunia: 6054
10. Universitas Mercu Buana Yogyakarta
- Peringkat Nasional: 134
- Peringkat dunia: 6313
11. Universitas Aisyiyah Yogyakarta
- Peringkat Nasional: 173
- Peringkat dunia: 7376
12. Universitas Teknologi Yogyakarta
- Peringkat Nasional: 206
- Peringkat dunia: 8264
13. Universitas Janabadra
- Peringkat Nasional: 243
- Peringkat dunia: 9001
14. Universitas PGRI Yogyakarta
- Peringkat Nasional: 245
- Peringkat dunia: 9057
15. Universitas Kristen Immanuel
- Peringkat Nasional: 317
- Peringkat dunia: 10338
16. Universitas Proklamasi 45
- Peringkat Nasional: 332
- Peringkat dunia: 10529
17. Universitas Cokroaminoto Yogyakarta