Adapun profil 3 SMA terbaik dan unggulan Kota Yogyakarta adalah sebagai berikut:
1. SMAN 3 YOGYAKARTA
Nilai total: 616,584
NPSN: 20403178
Ranking nasional: 7
SMA Negeri 3 Yogyakarta sudah berdiri sejak zaman penjajahan Belanda. Bahkan, sekolah ini telah ada sejak tahun 1918, karena sebuah dokumen menunjukkan bahwa pada tanggal 30 Februari 1938, sekolah ini merayakan ulang tahunnya yang ke-20.
Sampai dengan pecahnya Perang Dunia II (Desember 1941), sekolah ini dikenal dengan nama AMS (Algemeene Middelbare School) afdeeling B. Saat itu, sekolah ini hanya diisi oleh mereka dari golongan elite pribumi.
Diberlakukannya Kurikulum 1994, akhirnya sekolah ini berubah nama menjadi SMU Negeri 3 Yogyakarta, akan tetapi sejak diberlakukannya Kurikulum Berbasis Kompetensi dan Kurikulum Tingkat Satuan Pendidikan mulai 2004, nama sekolah ini diubah lagi menjadi SMA Negeri 3 Yogyakarta.