Berdasarkan kesimpulan tersebut dan karena saat itu Jenderal A.H Nasution belum diketahui keberadaannya, Mayjen Soeharto langsung mengambil alih pimpinan Angkatan Darat.
Langkah penumpasan G30S PKI pun dimulai dari 1-2 Oktober 1965.
Pada 2 Oktober 1965 juga, atas petunjuk dari Polisi Sukitman yang saat itu juga 'diculik' oleh PKI dan berhasil lolos, TNI AD berhasil menemukan lokasi sumur tempat jasad para perwira tinggi TNI AD 'dimakamkan'.***