2. Universitas Kristen Duta Wacana
- Peringkat Nasional/Indonesia: 80
- Peringkat Asia: 2015
- Peringkat Dunia: 5493
3. Institut Seni Indonesia Yogyakarta
- Peringkat Nasional/Indonesia: 110
- Peringkat Asia: 2959
- Peringkat Dunia: 7605
4. Universitas Janabadra
- Peringkat Nasional/Indonesia: 139
- Peringkat Asia: 3182
- Peringkat Dunia: 8200
5. Universitas Sarjanawiyata Tamansiswa
- Peringkat Nasional/Indonesia: 160
- Peringkat Asia: 3320
- Peringkat Dunia: 8571
6. Universitas Mercu Buana Yogyakarta
- Peringkat Nasional/Indonesia: 180
- Peringkat Asia: 3515
- Peringkat Dunia: 8966
7. Universitas Alma Ata
- Peringkat Nasional/Indonesia: 225
- Peringkat Asia: 3831
- Peringkat Dunia: 9655
8. Universitas Widya Mataram
- Peringkat Nasional/Indonesia: 288
- Peringkat Asia: 4303
- Peringkat Dunia: 10627
9. Universitas Nahdlatul Ulama Yogyakarta
- Peringkat Nasional/Indonesia: 346
- Peringkat Asia: 4694
- Peringkat Dunia: 11467