- Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Papua, Manokwari
Prodi Biologi Ilmu Kelautan (S1), Perikanan, Budidaya Perikanan, Ekowisata, Ilmu Kelautan, dan Manajemen Sumberdaya Perairan
- Fakultas Pertanian Universitas Papua, Manokwari
Prodi Agribisnis (S1), Agroteknologi, Budidaya Tanaman Pangan, Budidaya Tanaman Perkebunan, Ilmu Tanah
- Fakultas Peternakan Universitas Papua, Manokwari
Prodi Budidaya Ternak, Kesehatan Hewan, Nutrisi dan Makanan Ternak, Nutrisi dan Teknologi Pakan Ternak, dan Peternakan
- Fakultas Sastra dan Budaya Universitas Papua, Manokwari
Prodi Antropologi, Sastra Indonesia, dan Sastra Inggris
- Fakultas Teknik (FT) Universitas Papua, Manokwari
Prodi Teknik Sipil (S1), Teknik Informatika, Teknik Komputer, Teknik Elektro, dan Teknik Listrik
- Fakultas Teknik Pertambangan dan Perminyakan Universitas Papua, Manokwari
Prodi Teknik Geologi (S1), Teknik Perminyakan dan Gas Bumi (S1), Teknik Pertambangan (S1), dan Teknik Pertambangan (D3).