Adapun daftar 4 Profil SMP terbaik dan unggulan di Kabupaten Manokwari, Papua Barat versi nilai rerata UN Kemdikbud adalah sebagai berikut, dikutip seputarlampung.com dari puspendik.kemdikbud.go.id:
1. SMP NEGERI 1 MANOKWARI
- NPSN: 60400202
- Akreditasi: A
- Total rerata UN: 51,22
- Kode Pos: 98312
- Kab. Manokwari, Papua Barat
2. SMP NEGERI 2 MANOKWARI
- NPSN: 60400172